Pourtant, c’est bien exactement de ça qu’il s’agit.
L’inquisition n’est habilitée qu’à juger les doctrines pour dire si celles-ci sont chrétiennes ou non.
 
Ensuite, c’est le pouvoir civil qui y appliquait la peine qu’il jugeait nécessaire.
 
Le protestantisme n’a pas cessé d’être une hérésie après les guerres de religions, et c’est bien le pouvoir civil qui a décidé de ne pas appliquer de peine à celui convaincu de protestantisme...
 
Le pire, ce fut la chasse aux sorcières, quand les juges laïcs se sont arrogés eux-même le droit de déterminer qui était hérétique (cf Jean Bodin). Il est connu historiquement que c’est l’intervention de l’Église de Rome qui a permis de faire cesser ces délires, c’est la raison pour laquelle la "chasse aux sorcières" fut beaucoup plus limitée dans les pays catholiques que les pays musulmans.