J’ai fait l’expérience chez moi en ouvrant le premier livre sur le Moyen-Age que j’ai trouvé - un bouquin tout à fait généraliste écrit par des universitaires et édité par France Loisirs - et on n’y lit pas du tout que le Moyen-Age a été une période maudite et obscurantiste, bien au contraire ! En ce qui concerne la femme, cela fait belle lurette que l’on sait que le statut de la femme au Moyen-Age est privilégié et sans aucun doute meilleur qu’au XIXème siècle, qui a exalté le culte antique de la virilité et le patriarcat. Les femmes parviennent même parfois à accéder au pouvoir (régence). De nombreux médiévistes ont publié des thèses et des articles à ce sujet.
J’ai rouvert aussi mes vieux Lagarde et Michard (qui ont longtemps servi de base à l’apprentissage de la littérature française au lyçée), ni le Moyen-Age, ni la religion n’y sont traités de manière frivole ou injuste.
Je crois quand même que certains se complaisent dans de grossières exagérations et que l’historiographie du Moyen-Age a beaucoup évolué depuis le XIXème siècle et les hussards noirs de l’école républicaine. Et je ne parle même pas de la littérature médiévale qui est l’objet de nombreuses études... J’ai aussi vu récemment un docu-fiction brillamment écrit sur Louis XI, il n’y avait aucun aspect caricatural.

Le monde ne se réduit pas à internet et sa culture "mainstream" ou "alternative" en conserve... il y a des tas de gens sérieux qui connaissent et respectent cette période (sans tomber dans l’idéalisation naïve non plus).

A propos de "tuez les tous, Dieu reconnaîtra les siens", le fait de savoir si cette phrase a été ou non prononcée n’a guère d’intérêt (il faudrait alors passer des dizaines d’années à redéfinir précisément la frontière entre histoire et folklore) d’autant plus que la phrase sonne théologiquement juste quand on fait l’effort de se replonger dans le contexte. En effet, il n’est pas difficile d’imaginer que des catholiques aient ressenti quelques scrupules à tuer d’autres chrétiens ayant reçu le baptême (même accusés le cas échéant d’hérésie) et redouté la damnation de leur âme. La phrase est un rappel - certes, un peu retors - à la doctrine de la Prédestination. Dieu ayant accordé sa grâce de toute éternité il "reconnaîtra les siens", c’est à dire les Elus ("et alors je connaîtrai comme j’ai été connu" chez Saint Paul). 

Je ne crois pas que les gens soient aussi idiots que ça et puissent "haïr" une époque pour une simple citation tronquée ou inventée...